Lima Jenis Mekanisme Penyambungan Gen

Isi

• Pemahaman Dasar Penyambungan Alternatif
• Exon Skipping
• Ekson yang Saling Eksklusif
• Alternatif 3 ’Situs Akseptor
• Alternatif 5 'Situs Donor
• Retensi Intron

Penyambungan alternatif adalah komponen integral keanekaragaman hayati. Berbagai spesies menggunakan mekanisme ini untuk menjalankan fungsi pengaturan. Keuntungan utama dari penyambungan adalah bahwa banyak protein dapat terbentuk dari satu gen melalui penyambungan intron dan ekson. Namun, mekanisme ini juga dapat menyebabkan berbagai penyakit jika dibiarkan tidak diatur. Mekanisme yang paling umum adalah skipping exon, ekson yang saling eksklusif, situs akseptor alternatif, situs donor alternatif dan retensi intron.

Pemahaman Dasar Penyambungan Alternatif

••• Gambar Comstock / Comstock / Getty

Tidak berlebihan untuk mengatakan bahwa tanpa penyambungan alternatif, keanekaragaman hayati tidak akan mungkin terjadi. Penyambungan alternatif dapat menghasilkan banyak protein dari satu gen. Fleksibilitas ini memungkinkan gen yang sama berkontribusi pada sifat-sifat yang berbeda. Hal ini dimungkinkan karena ekson, yang merupakan rentangan nukleotida yang tersisa dalam produk RNA, dan intron, yang dihilangkan melalui penyambungan RNA. Ada banyak mode penyambungan alternatif yang berkontribusi terhadap keanekaragaman hayati pada eukariota. Aktivator, seperti mulai kodon AUG, di situs sambatan mempromosikan penyambungan. Mekanisme ini bervariasi di setiap situasi dan dianggap mengatur fungsi sel berdasarkan kondisi tertentu. Namun, splicing yang tidak tepat juga dapat berkontribusi pada berbagai penyakit, termasuk kanker.

Exon Skipping

••• Gambar Comstock / Gambar Comstock / Getty

Mekanisme ini juga dikenal sebagai exon kaset, di mana ekson disambung keluar dari gen selama transkripsi. Contohnya adalah gen dsx dalam D. melanogaster (lalat buah). Laki-laki memiliki ekson 1, 2, 3, 5 dan 6 sedangkan perempuan memiliki 1, 2, 3 dan 4. Sinyal polyadenylation di ekson 4 menyebabkan transkripsi berhenti pada titik itu. Exon 4 ditambahkan ke betina karena salah satu aktivator hanya ada pada betina dan bukan pada jantan.

Ekson yang Saling Eksklusif

••• Thomas Northcut / Lifesize / Getty Images

Dalam kasus ekson yang saling eksklusif, hanya satu dari dua ekson berturut-turut dipertahankan selama transkripsi. Contohnya adalah regulasi ekson 8a dan 8 dalam saluran kalsium CaV1.2. Pada sindrom Timothy, bentuk-bentuk alternatif dari dua ekson ini dapat menyebabkan gejala penyakit yang berbeda, yang menyebabkan gangguan homeostasis kalsium yang dibutuhkan untuk kontraksi otot. Namun, kedua ekson tidak dapat ada pada pasien; hanya satu yang ditranskripsi, meskipun keduanya ada dalam gen.

Alternatif 3 ’Situs Akseptor

••• Gambar Comstock / Comstock / Getty

Sambungan sambungan di ujung 3 'digunakan, mengubah batas 5' dari ekson hilir. Contohnya adalah protein aktivator Transformer (Tra) yang ada pada betina D. melanogaster (lalat buah). Gen asli untuk Tra berisi dua situs akseptor di mana gen dapat membelah selama transkripsi. Laki-laki menggunakan situs akseptor hulu, yang mencakup kodon pemberhentian awal. Ini membentuk protein non-fungsional. Betina menggunakan situs akseptor hilir, yang menyebabkan kodon stop dikeluarkan sebagai bagian dari intron, membentuk protein Tra yang berfungsi.

Alternatif 5 'Situs Donor

••• Gambar Comstock / Gambar Comstock / Getty

Sambungan sambungan di 5 'digunakan, mengubah batas 3' dari exon hulu. Sementara situs akseptor alternatif mengarah pada variasi kecil dalam urutan protein, situs donor alternatif dapat menyebabkan perbedaan drastis dalam urutan dan struktur protein karena dapat menyebabkan perubahan bingkai. Contohnya adalah penyambungan situs donor alternatif gen BTNL2. Penggunaan situs hulu, alih-alih situs hilir, mengarah ke protein ringkas tanpa domain C-terminal IgC atau helix transmembran. Ini menghasilkan kecenderungan penyakit radang kronis.

Retensi Intron

••• Ablestock.com/AbleStock.com/Getty Images

Mirip dengan ekson skipping, ekson dipertahankan dalam mRNA, tetapi tidak seperti skipping ekson, ekson tidak diapit oleh intron. Jika intron memang ada, mereka sering dikodekan dalam daerah pengkodean di antara asam amino dekat oleh ekson, kodon stop, atau pergeseran dalam bingkai pembacaan yang menyebabkan protein menjadi tidak berfungsi. Ini adalah mekanisme penyambungan alternatif yang paling tidak umum.