Isi
- Definisi Genotipe
- Mengenal Genotipe: Punnett Square
- Reaksi Rantai Polimerase
- Probe Hibridisasi
- Sequencing DNA langsung
Istilah genotipe mengacu pada susunan genetik lengkap dari suatu organisme. Ini juga digunakan dalam menggambarkan variasi gen yang berbeda, yang dikenal sebagai alel. Manusia memiliki dua alel untuk setiap posisi genetik, atau lokus.Secara bersama-sama, setiap pasangan alel dianggap sebagai genotipe spesifik.
Mengetahui genotipe atau contoh genotipe dari seseorang dapat menjadi penting untuk memahami ekspresi genetik, mendiagnosis penyakit, mempelajari tentang mutasi genetik, dan banyak lagi.
Definisi Genotipe
Mari kita mulai dengan definisi genotipe tertentu. Genotipe individu adalah informasi genetik yang diturunkan yang dimiliki individu itu. Ini merujuk pada gen, DNA, alel, dll dalam satu kata yang mencakup semua. Contoh akan menggambarkan genotipe warna bunga sebagai RR (artinya mereka memiliki dua alel "merah", RR, untuk warnanya) atau Rr (satu alel "merah", R, dan satu alel "merah muda", r, untuk warna) .
Fenotip Anda, di sisi lain, adalah apa dan individu secara fisik menunjukkan bahwa ditentukan oleh genotipe yang mereka miliki. Sementara dua individu dapat memiliki fenotipe yang sama, mereka dapat memiliki genotipe yang sama sekali berbeda. Mengikuti contoh bunga dari sebelumnya, bunga RR dan Rr akan tampak merah karena merah lebih dominan daripada merah muda. Namun, mereka berbeda dalam genotipe mereka karena satu homozigot (RR) dan satu heterozigot (Rr).
Baca lebih lanjut tentang definisi, alel, dan contoh genotipe.
Mengenal Genotipe: Punnett Square
Kotak Punnett adalah salah satu cara paling sederhana untuk menentukan genotipe. Kotak sebenarnya adalah mini-chart yang digunakan untuk menentukan genotipe potensial untuk keturunan sehubungan dengan sifat tertentu.
Untuk membuat kotak Punnett, tuliskan semua alel yang mungkin melintasi bagian atas kotak untuk satu induk dan semua alel yang mungkin untuk induk lainnya di sisi kiri. Setiap alel yang terdaftar akan menjadi kolom, untuk alel atas, atau baris, untuk alel sisi kiri, di dalam kotak. Kotak diisi saat Anda menuliskan alel dari atas di kolom masing-masing dan kemudian menuliskan alel dari sisi di baris masing-masing, membuat kuadrat penuh genotipe potensial.
Contoh genotipe menggunakan kotak Punnett adalah eksperimen kacang klasik yang dilakukan oleh Gregor Mendel. Lihat contoh genotipe spesifik dan kotak Punnett di sini.
Reaksi Rantai Polimerase
Dikembangkan selama tahun 1980-an, reaksi rantai polimerase (PCR) menghasilkan tegakan DNA spesifik berdasarkan untai cetakan. Selain untai cetakan, DNA polimerase, nukleotida, dan potongan pendek DNA untai tunggal diperlukan untuk reaksi PCR.
Pada titik tertentu, reaksi PCR mulai menghasilkan salinan secara eksponensial, dan hanya selama fase ini dimungkinkan untuk menentukan jumlah asli dari urutan target dalam sampel. Metode ini digunakan untuk keperluan sekuensing, kloning, dan rekayasa genetika.
Baca lebih lanjut tentang perbedaan antara kloning PCR.
Probe Hibridisasi
Probe hibridisasi digunakan untuk menentukan apakah karakteristik fisik disebabkan oleh genotipe. Prosesnya dimulai dengan pencernaan lengkap DNA yang akan dianalisis diikuti dengan pemindahannya ke membran filter. Kemudian probe ditambahkan ke filter dan diizinkan untuk mengikat ke urutan target.
Setelah sekitar 24 jam, filter dicuci untuk menghilangkan probe yang tidak terikat. Masalah hibridisasi juga dapat digunakan untuk menentukan efektivitas proses kloning atau mengetahui jumlah salinan gen tertentu.
Sequencing DNA langsung
Proyek Genom Manusia mengarah pada pengembangan sejumlah alat pengurutan DNA yang kuat. Selain decoding genom lengkap Homo sapiens, alat-alat ini telah memungkinkan para ilmuwan untuk mengurutkan genom lengkap dari berbagai organisme lain, termasuk tikus, tikus, dan beras. Alat pengurutan canggih memungkinkan ahli genetika saat ini untuk membandingkan dan memanipulasi sejumlah besar DNA dengan cepat dan murah.
Ini akan memungkinkan untuk menentukan peran genetika dalam kerentanan penyakit, respons genetik organisme terhadap rangsangan lingkungan dan melacak evolusi suatu sifat atau spesies, menurut National Human Genome Research Institute.