Isi
- Produksi Protein dari Asam Amino
- Ikatan Peptida Antara Asam Amino
- Rantai Samping Asam Amino
- Urutan Asam Amino dan Pelipat Protein
- Rantai Samping dan Lipat
- Jumlah Kombinasi Asam Amino
Rantai panjang, atau polimer, dari asam amino disebut protein (meskipun protein tidak harus secara eksklusif asam amino). Asam amino dihubungkan oleh apa yang disebut "ikatan peptida." Urutan asam amino ditentukan oleh urutan nukleotida ("alfabet" genetik) dalam gen DNA, yang pada gilirannya menentukan bagaimana protein terlipat dan berfungsi.
Produksi Protein dari Asam Amino
Proses menghubungkan asam amino ke dalam protein dimulai dari inti sel. Messenger RNA (mRNA) untuk suatu gen dibuat menggunakan hamparan DNA sebagai templat. MRNA kemudian bergerak ke luar nukleus ke pembuat protein yang disebut "ribosom." Di sinilah protein dibuat. Dalam ribosom, transfer RNA (tRNA) kemudian menempelkan asam amino ke mRNA. Pada dasarnya mRNA digunakan sebagai templat untuk membangun protein.
Ikatan Peptida Antara Asam Amino
Asam amino bergabung head-to-tail dalam polimer linier panjang. Secara khusus, gugus asam karboksilat (-CO) dari satu asam amino melekat pada gugus amino (-NH) berikutnya. Ikatan ini disebut "ikatan peptida." Rantai asam amino semacam itu disebut "polipeptida."
Rantai Samping Asam Amino
Asam amino memiliki rantai samping yang melekat pada atom karbon pusat. Rantai samping ini memiliki karakteristik elektrostatik (ikatan) yang berbeda. Ini penting dalam bagaimana protein linear awalnya terlipat ketika dilepaskan dari template mRNA-nya.
Urutan Asam Amino dan Pelipat Protein
Bentuk protein ditentukan oleh urutan asam amino. Ikatan dalam rantai polipeptida yang panjang memungkinkan rotasi bebas atom, yang memberikan tulang punggung protein fleksibilitas yang besar. Namun, sebagian besar rantai polipeptida hanya menjadi satu bentuk, dan sebagian besar melakukannya secara spontan.
Rantai Samping dan Lipat
Lipat ditentukan oleh urutan rantai samping asam amino. Rantai samping ini saling berinteraksi dengan air di dalam sel. Rantai sisi kutub cenderung memuntir ke permukaan air. Rantai samping nonpolar berubah menjadi pusat bola protein, menjadi hidrofobik (tidak menyukai air). Distribusi situs polar dan nonpolar karenanya merupakan salah satu faktor terpenting yang mengatur pelipatan protein.
Jumlah Kombinasi Asam Amino
20 asam amino digunakan untuk membuat protein. Walaupun ada 20 ^ polipeptida berbeda yang panjangnya asam amino, sebagian kecil dari protein yang dihasilkan akan stabil. Sebagian besar akan memiliki banyak bentuk dengan tingkat energi yang hampir setara. Mampu mengubah bentuk dengan mudah untuk mengadopsi tingkat energi yang berbeda, karena itu mereka tidak akan cukup stabil untuk berguna bagi organisme. Oleh karena itu satu asam amino di tempat yang salah dapat membuat protein tidak berguna. Oleh karena itu, sebagian besar mutasi pada DNA tidak menguntungkan organisme. Hanya melalui sejumlah besar trial and error protein yang berguna berkembang.