Isi
- TL; DR (Terlalu Panjang; Tidak Dibaca)
- Apa itu Ribosome?
- Apa yang Dilakukan Ribosom?
- Tiga Langkah Produksi Protein
- Apa itu DNA Ribosom?
- Signifikansi untuk rDNA dan Penyakit
- DNA dan Penuaan Ribosom
Semua makhluk hidup membutuhkan protein untuk berbagai fungsi. Di dalam sel, para ilmuwan mendefinisikan ribosom sebagai pembuat protein tersebut. DNA ribosom (rDNA), sebaliknya, berfungsi sebagai kode genetik prekursor untuk protein-protein tersebut dan melakukan fungsi-fungsi lain juga.
TL; DR (Terlalu Panjang; Tidak Dibaca)
Ribosom berfungsi sebagai pabrik protein di dalam sel-sel organisme. DNA ribosom (rDNA) adalah kode prekursor untuk protein tersebut, dan melayani fungsi penting lainnya dalam sel.
Apa itu Ribosome?
Seseorang dapat mendefinisikan ribosom sebagai pabrik protein molekuler. Paling sederhana, ribosom adalah jenis organel yang ditemukan dalam sel semua makhluk hidup. Ribosom dapat mengapung dengan bebas di sitoplasma sel, atau dapat berada di permukaan sel retikulum endoplasma (ER). Bagian ER ini disebut ER kasar.
Protein dan asam nukleat terdiri dari ribosom. Sebagian besar berasal dari nukleolus. Ribosom terbuat dari dua subunit, satu lebih besar dari yang lain. Dalam bentuk kehidupan yang lebih sederhana seperti bakteri dan archaebacteria, ribosom dan subunitnya lebih kecil daripada bentuk kehidupan yang lebih maju.
Dalam organisme yang lebih sederhana ini, ribosom disebut sebagai 70S ribosom dan terbuat dari subunit 50S dan subunit 30S. "S" mengacu pada laju sedimentasi untuk molekul dalam centrifuge.
Pada organisme yang lebih kompleks seperti manusia, tumbuhan dan jamur, ribosom lebih besar, dan disebut sebagai ribosom 80S. Ribosom tersebut masing-masing terdiri dari subunit 60S dan 40S. Mitokondria memiliki ribosom 70S mereka sendiri, mengisyaratkan kemungkinan kuno bahwa eukariota mengonsumsi mitokondria sebagai bakteri, namun menjadikannya sebagai simbiotik yang bermanfaat.
Ribosom dapat dibuat dari sebanyak 80 protein, dan sebagian besar massanya berasal dari RNA ribosom (rRNA).
Apa yang Dilakukan Ribosom?
Itu fungsi utama dari ribosom adalah membangun protein. Ini dilakukan dengan menerjemahkan kode yang diberikan dari inti sel melalui mRNA (messenger ribonucleic acid). Dengan menggunakan kode ini, ribosom akan berdampingan dengan asam amino yang dibawa oleh tRNA (transfer asam ribonukleat).
Pada akhirnya polipeptida baru ini akan dilepaskan ke dalam sitoplasma dan selanjutnya dimodifikasi sebagai protein baru yang berfungsi.
Tiga Langkah Produksi Protein
Meskipun mudah untuk secara umum mendefinisikan ribosom sebagai pabrik protein, membantu memahami yang sebenarnya langkah-langkah produksi protein. Langkah-langkah ini harus dilakukan secara efisien dan benar untuk memastikan tidak ada kerusakan pada protein baru terjadi.
Langkah pertama produksi protein (alias terjemahan) disebut inisiasi. Protein khusus membawa mRNA ke subunit yang lebih kecil dari ribosom, di mana ia masuk melalui celah. Kemudian tRNA disiapkan dan dibawa melalui celah lain. Semua molekul ini menempel di antara subunit yang lebih besar dan lebih kecil dari ribosom, membuat ribosom aktif. Subunit yang lebih besar utamanya berfungsi sebagai katalis, sedangkan subunit yang lebih kecil berfungsi sebagai dekoder.
Langkah kedua, pemanjangan, dimulai ketika mRNA "dibaca." tRNA menghasilkan asam amino, dan proses ini berulang, memanjang rantai asam amino. Asam amino diambil dari sitoplasma; mereka disuplai oleh makanan.
Penghentian merupakan akhir dari pembuatan protein. Ribosom membaca kodon stop, suatu urutan gen yang memerintahkannya untuk menyelesaikan pembentukan protein. Protein yang disebut protein faktor pelepasan membantu ribosom melepaskan protein lengkap ke dalam sitoplasma. Protein yang baru dirilis dapat melipat atau dimodifikasi modifikasi pasca-terjemahan.
Ribosom dapat bekerja dengan kecepatan tinggi untuk bergabung dengan asam amino bersama, dan kadang-kadang dapat bergabung dengan 200 dari mereka satu menit! Protein yang lebih besar bisa memakan waktu beberapa jam untuk terbentuk. Protein ribosom terus melakukan fungsi penting untuk kehidupan, membentuk otot dan jaringan lainnya. Sel mamalia dapat mengandung sebanyak 10 miliar molekul protein dan 10 juta ribosom! Ketika ribosom menyelesaikan pekerjaan mereka, subunit mereka terpisah dan dapat didaur ulang atau dipecah.
Para peneliti menggunakan pengetahuan mereka tentang ribosom untuk membuat antibiotik baru dan obat-obatan lainnya. Misalnya, ada antibiotik baru yang melakukan serangan yang ditargetkan pada 70-an ribosom di dalam bakteri. Ketika para ilmuwan mempelajari lebih lanjut tentang ribosom, lebih banyak pendekatan terhadap obat-obatan baru tidak diragukan lagi akan terungkap.
Apa itu DNA Ribosom?
DNA ribosom, atau ribosomal deoxyribonucleic acid (rDNA), adalah DNA yang mengkode protein ribosom yang membentuk ribosom. RDNA ini merupakan bagian yang relatif kecil dari DNA manusia, tetapi perannya sangat penting untuk beberapa proses. Sebagian besar RNA yang ditemukan pada eukariota berasal dari RNA ribosom yang ditranskripsi dari rDNA.
Transkripsi ini dari rDNA ditanamkan selama siklus sel.RDNA itu sendiri berasal dari nukleolus, yang terletak di dalam nukleus sel.
Tingkat produksi rDNA dalam sel bervariasi tergantung pada tingkat stres dan nutrisi. Ketika ada kelaparan, transkripsi rDNA turun. Ketika ada sumber daya yang melimpah, produksi rDNA meningkat.
DNA ribosom bertanggung jawab untuk mengontrol metabolisme sel, ekspresi gen, respons terhadap stres, dan bahkan penuaan. Diperlukan tingkat transkripsi rDNA yang stabil untuk menghindari kematian sel atau pembentukan tumor.
Fitur yang menarik dari rDNA adalah seri besar gen berulang. Ada lebih banyak pengulangan rDNA dari yang dibutuhkan untuk rRNA. Sementara alasan untuk ini tidak jelas, para peneliti berpikir ini mungkin ada hubungannya dengan kebutuhan tingkat sintesis protein yang berbeda sebagai titik berbeda dalam pengembangan.
Urutan rDNA berulang ini dapat menyebabkan masalah dengan integritas genom. Mereka sulit untuk ditranskripsi, ditiru dan diperbaiki, yang pada gilirannya menyebabkan ketidakstabilan keseluruhan yang dapat menyebabkan penyakit. Setiap kali transkripsi rDNA terjadi pada tingkat yang lebih tinggi, ada peningkatan risiko untuk istirahat dalam rDNA dan kesalahan lainnya. Regulasi DNA berulang adalah penting untuk kesehatan organisme.
Signifikansi untuk rDNA dan Penyakit
Masalah Ribosomal DNA (rDNA) telah terlibat dalam sejumlah penyakit pada manusia, termasuk gangguan neurodegeneratif dan kanker. Ketika ada yang lebih besar ketidakstabilan rDNA, masalah terjadi. Hal ini disebabkan urutan berulang yang ditemukan dalam rDNA, yang rentan terhadap peristiwa rekombinasi yang menghasilkan mutasi.
Beberapa penyakit dapat terjadi akibat peningkatan ketidakstabilan rDNA (dan sintesis ribosom dan protein yang buruk). Para peneliti telah menemukan bahwa sel-sel dari penderita sindrom Cockayne, sindrom Bloom, sindrom Werner dan ataksia-telangiectasia mengandung peningkatan ketidakstabilan rDNA.
Ketidakstabilan pengulangan DNA juga ditunjukkan dalam sejumlah penyakit neurologis seperti penyakit Huntington, ALS (amyotrophic lateral sclerosis) dan demensia frontotemporal. Para ilmuwan berpikir bahwa neurodegenerasi terkait rDNA muncul dari transkripsi rDNA tinggi yang menghasilkan kerusakan rDNA dan transkrip rRNA yang buruk. Masalah dengan produksi ribosom juga bisa berperan.
Sejumlah kanker tumor padat kebetulan menunjukkan penataan ulang rDNA, termasuk beberapa urutan berulang. Jumlah salinan rDNA mempengaruhi bagaimana ribosom terbentuk, dan karenanya protein mereka berkembang. Peningkatan produksi protein oleh ribosom memberikan petunjuk untuk hubungan antara urutan pengulangan DNA ribosom dan perkembangan tumor.
Harapannya adalah bahwa terapi kanker baru dapat dibuat yang mengeksploitasi kerentanan tumor akibat rDNA berulang.
DNA dan Penuaan Ribosom
Para ilmuwan baru-baru ini menemukan bukti bahwa rDNA juga berperan penuaan. Para peneliti menemukan bahwa seiring bertambahnya usia hewan, rDNA mereka mengalami perubahan epigenetik yang disebut metilasi. Grup metil tidak mengubah urutan DNA, tetapi mereka mengubah cara gen diekspresikan.
Petunjuk potensial lain dalam penuaan adalah pengurangan pengulangan rDNA. Penelitian lebih lanjut diperlukan untuk menjelaskan peran rDNA dan penuaan.
Ketika para ilmuwan mempelajari lebih lanjut tentang rDNA dan bagaimana hal itu dapat mempengaruhi ribosom dan pengembangan protein, masih ada janji besar untuk obat-obatan baru untuk mengobati tidak hanya penuaan, tetapi juga kondisi yang merusak seperti kanker dan gangguan neurologis.