Isi
Genomik adalah cabang genetika yang mempelajari perubahan skala besar pada genom organisme. Genomik dan sub-bidang transkriptomiknya, yang mempelajari perubahan genom-lebar dalam RNA yang ditranskripsi dari DNA, mempelajari banyak gen sekaligus. Genomik mungkin juga melibatkan membaca dan meluruskan urutan DNA atau RNA yang sangat panjang. Menganalisis dan menafsirkan data berskala besar dan rumit seperti itu membutuhkan bantuan komputer. Pikiran manusia, yang luar biasa, tidak mampu menangani informasi sebanyak ini. Bioinformatika adalah bidang hibrid yang menyatukan pengetahuan biologi dan pengetahuan ilmu informasi, yang merupakan sub-bidang ilmu komputer.
Genom Mengandung Banyak Informasi
Genom organisme sangat besar. Genom manusia diperkirakan memiliki tiga miliar pasangan basa yang mengandung sekitar 25.000 gen. Sebagai perbandingan, lalat buah diperkirakan memiliki 165 miliar pasangan basa yang mengandung 13.000 gen. Selain itu, sub-bidang genomik yang disebut studi transkriptomika gen mana, di antara puluhan ribu dalam suatu organisme, dinyalakan atau dimatikan pada waktu tertentu, melintasi beberapa titik waktu, dan beberapa kondisi eksperimental pada setiap titik waktu. Dengan kata lain, data "omics" mengandung sejumlah besar informasi yang tidak dapat dipahami oleh pikiran manusia tanpa bantuan metode komputasi dalam bioinformatika.
Data Biologis
Bioinformatika penting untuk penelitian genetik karena data genetik memiliki kelemahan. Con adalah biologi. Bentuk kehidupan memiliki aturan perilaku tertentu. Hal yang sama berlaku untuk jaringan dan sel, gen dan protein. Mereka berinteraksi dengan cara tertentu dan mengatur satu sama lain dengan cara tertentu. Data berskala besar dan kompleks yang dihasilkan dalam genomik tidak akan masuk akal tanpa pengetahuan yang sebenarnya tentang bagaimana bentuk kehidupan bekerja. Data yang dihasilkan oleh genomik dapat dianalisis dengan metode yang sama yang digunakan oleh insinyur dan fisikawan yang mempelajari pasar keuangan dan serat optik, tetapi menganalisis data dengan cara yang masuk akal memerlukan pengetahuan biologi. Dengan demikian, bioinformatika menjadi bidang ilmu hybrid yang sangat berharga.
Menghancurkan Ribuan Angka
Angka-angka adalah cara untuk mengatakan bahwa seseorang sedang melakukan perhitungan. Bioinformatika mampu menghasilkan puluhan ribu angka dalam beberapa menit, tergantung pada seberapa cepat komputer dapat memproses informasi. Penelitian Omics menggunakan komputer untuk menjalankan algoritma - perhitungan matematis - dalam skala besar untuk menemukan pola dalam kumpulan data besar. Algoritma umum mencakup fungsi seperti pengelompokan hierarkis (Lihat Referensi 3) dan analisis komponen utama. Keduanya adalah teknik untuk menemukan hubungan antara sampel yang memiliki banyak faktor di dalamnya. Ini mirip dengan menentukan apakah etnis tertentu lebih umum di antara dua bagian dalam buku telepon: nama belakang yang dimulai dengan A versus nama belakang yang dimulai dengan B.
Biologi Sistem
Bioinformatika telah memungkinkan untuk mempelajari bagaimana suatu sistem yang memiliki ribuan bagian yang bergerak berperilaku pada tingkat semua bagian yang bergerak sekaligus. Itu seperti menyaksikan sekawanan burung terbang serempak atau sekawanan ikan berenang serempak. Sebelumnya, ahli genetika hanya mempelajari satu gen pada satu waktu. Meskipun pendekatan itu masih memiliki jumlah yang luar biasa dan akan terus melakukannya, bioinformatika telah memungkinkan penemuan baru dibuat. Biologi sistem adalah pendekatan untuk mempelajari sistem biologis dengan mengkuantifikasi beberapa bagian yang bergerak, seperti mempelajari kecepatan kolektif berbagai kantung burung yang terbang sebagai satu kawanan besar yang membelok.