Isi
Fosil dapat dikategorikan menjadi lima jenis, berdasarkan proses pengawetannya. Ketika suatu organisme dikubur oleh sedimen, ia mungkin meninggalkan fosil jika sedimen itu berubah menjadi batuan. Kesan yang ditinggalkan di batu oleh organisme bukanlah bahan asli seperti jaringan dan kerangka dari makhluk itu. Bahan organik diganti, diubah atau dilarutkan seiring waktu geologis.
Permineralisasi
Setelah organisme dimakamkan, ruang kosong dapat diserang oleh air tanah. Jika air kaya akan mineral, mereka akan mengendap atau mengkristal dalam bentuk yang sama dengan organisme. Kristal mengisi dan mengganti organisme, yang larut. Jika organisme meluruh perlahan, maka lebih banyak kristal dapat terbentuk, memberikan tingkat detail yang lebih tinggi.
Cetakan dan gips
Seringkali, organisme dihapus sepenuhnya dari waktu ke waktu dengan pembubaran atau pembusukan. Rongga yang tercipta saat organisme menghilang dapat menjadi penuh dengan sedimen. Setelah organisme hilang, hanya jejak yang tersisa di batu. Jika sebuah fosil adalah im negatif dari luar organisme, maka cetakan terbentuk. Jika organisme diisi oleh sedimen, maka itu adalah gips.
Rekristalisasi
Jika bahan organik tidak dihilangkan, dapat diubah menjadi bagian dari fosil. Panas dan tekanan dari penguburan dalam sedimen dapat mengubah struktur bahan asli dari organisme. Kalsium dalam tulang dapat direkristalisasi menjadi kalsit atau aragonit. Senyawa dalam suatu organisme yang direkristalisasi disusun ulang untuk membentuk mineral baru. Rekristalisasi paling sering terjadi pada tulang atau cangkang yang tinggi kalsium.
Karbonisasi
Makhluk hidup mengandung sejumlah besar karbon. Ketika mereka dikubur dan dikompresi, mereka dapat berubah menjadi cetakan hitam gelap dari organisme asli. Panas dan tekanan yang hebat melumatkan fosil dan mengubahnya. Dengan panas dan tekanan yang cukup, batubara terbentuk. Fosil daun tanaman ditemukan tidak terdistorsi tetapi dikarbonisasi karena letaknya rata dan dua dimensi. Bahan tidak dihilangkan oleh karbonisasi, tetapi diubah.
Bioimmuration
Bentuk kehidupan kadang tumbuh satu sama lain. Kehidupan laut seperti karang menciptakan struktur terjalin yang sering mengkonsumsi atau mengelilingi potongan karang atau spons laut lainnya. Jamur atau rongga dapat tertinggal di dalam sisa-sisa fosil karang, yang merupakan fosil yang terpisah. Organisme tanpa cangkang keras akan meninggalkan ruang kosong di makhluk yang lebih besar di sekitarnya.